枯萎病是佛手瓜的一种普通病害。零星发生。

佛手瓜生长中后期发病，开始病株下部叶片褪绿，植株开始萎蔫，最后病株枯死。剖茎可见维管束变褐，潮湿时病部产生白色至粉红色霉状物。

病原主要以菌丝体和厚垣孢子随病残体遗落土中或未腐熟的带菌肥料及种子上越冬。厚垣孢子在土中能存活5～10年。病土和病肥中存活的病原，成为第2年主要初侵染源。病原从根部自然裂口或伤口侵入，在根茎维管束内生长发育，通过堵塞维管束和分泌毒素，破坏植株正常输导机能而引起萎蔫。

品种间抗性有一定差异。发病温限8～34℃，最适24～28℃。连作或土质黏重、地势低洼、排水不良、地温低、耕作粗放、土壤过酸(pH4.5～6)和施肥不足或偏施氮肥，或施用未腐熟肥料，致植株根系发育不良，都会使病害加重。

(1)农业防治。选用抗病品种。用无病新土育苗，采用营养钵分苗。选择5年以上未种过瓜类蔬菜的地块种植，与其他蔬菜实行轮作。施用充分腐熟肥料，减少伤口。浇水时做到小水勤浇，避免大水漫灌。结瓜期应分期施肥，忌施入未腐熟的人粪尿。(2)化学防治：苗床用50%多菌灵可湿性粉剂8g/m?处理畦面。每公顷用50%多菌灵可湿性粉剂 60kg，混入细干土，拌匀后施于定植穴内。用30%恶霉灵水剂 600～800倍液，在播种时喷淋1次，播种后10～15天再喷淋1次，本田灌根2次，在移栽时灌根1次，15天后再灌根1次。发病前或发病初期在发病初或发病前，用50%多菌灵可湿性粉剂 500倍液或2%农抗120水剂 200倍液灌根，每株用药液0.25kg，隔7～10天灌1次，连灌3次，防治效果较好。另据室内抑菌试验表明，菇渣和鸡粪浸提液对黄瓜枯萎病的抑菌效果较好。